2023-2024 学年第一学期 第 18 周
总 060 期 提交时间：2023年12月30日
1.本周目标
(1) 留意投稿反馈信息，并进行相应的调整 (2) 继续准备硕士毕业论文，以及自身发展的相关事务
2.本周实际做的工作
(1) 参考相关研究的硕士论文，确定了绪论和背景章节中需要涉及的基本内容 (2) 将先前准备课程作业（论文）的内容进行调整修改，作为一部分背景内容 (3) 每日关注期刊的投稿反馈信息（暂未提示受理，经上网搜索确认流程和状态并无异常，可能受欧美圣诞假期影响）
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
5.下周目标
继续准备硕士毕业论文，以及自身发展的相关事务
6.本周收获
对相关研究硕士论文的框架，及绪论和背景部分的细节有了进一步的了解
7.为课题组所做的服务性工作
2023-2024 学年第一学期 第 17 周
总 059 期 提交时间：2023年12月23日
1.本周目标
(1) 完成新期刊的投稿及材料提交等工作 (2) 规划硕士论文初稿写作及完成时间
2.本周实际做的工作
(1) 了解期刊 Proceeding B 的投稿要求，修改参考文献格式，重新准备稿件 (2) 整理期刊要求的论文数据信息（用于绘图的数据及README文件等），上传和提交投稿材料
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
5.下周目标
(1) 留意投稿反馈信息，并进行相应的调整 (2) 继续准备硕士毕业论文，以及自身发展的相关事务
6.本周收获
7.为课题组所做的服务性工作
2023-2024 学年第一学期 第 16 周
总 058 期 提交时间：2023年12月16日
1.本周目标
(1) 完成稿件格式调整、逻辑和语义表达等的修改完善等工作 (2) 了解期刊投稿流程，上传稿件与材料
2.本周实际做的工作
(1) 学习完整的期刊投稿流程 (2) 参考网络上的投稿信和Title Page模板，确定格式并准备好投稿所需材料 (3) 上传稿件，并确认提供的文件能够成功building pdf，完成全部投稿材料的提交
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
5.下周目标
(1) 准备自身发展的相关事务（申请材料和线上会议等） (2) 规划硕士论文初稿写作及完成时间
6.本周收获
7.为课题组所做的服务性工作
2023-2024 学年第一学期 第 15 周
总 057 期 提交时间：2023年12月9日
1.本周目标
完成论文图片表格的添加及相关引用，继续进行拼写和语法检查
2.本周实际做的工作
(1) 将论文图片、表格、参考文献等内容插入到tex格式的稿件中，根据相关网站提供的模板和指引编译完成pdf初稿 (2) 了解一些论文投稿格式（tex和docx）相互转换的方式，学习word中bib参考文献引用插件，方便后续根据期刊要求进行调整 (3) 修改和重写句子若干
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
5.下周目标
(1) 完成稿件格式调整、逻辑和语义表达等的修改完善等工作 (2) 了解一下期刊投稿流程，做好毕业论文下一步工作的时间安排，以便规划近期自身发展的相关事务
6.本周收获
7.为课题组所做的服务性工作
2023-2024 学年第一学期 第 14 周
总 056 期 提交时间：2023年12月2日
1.本周目标
完成文章和参考文献编辑器配置，继续根据投稿要求进行论文格式的修改
2.本周实际做的工作
(1) 下载Elsevier官方提供的latex模板，将初稿文字内容套入到latex模板中，配置编辑器，并调试编译成功 (2) 根据相关要求，准备参考文献bib文件，方便引用 (3) 根据相关要求，将全文图片调整为pdf格式 (4) 重写讨论部分多智能体系统设计段落，增加多智能体强化学习相关内容： In Multi-Agent Reinforcement Learning (MARL), a key challenge is designing systems that enable agents to collaboratively achieve a shared objective in a given environment, while navigating both cooperative and competitive interactions. Reinforcement learning optimize policies through value function approximation. However, the gradient-based optimization may encounter difficulties in obtaining accurate value estimates in multi-agents settings. For effective learning, agents need to understand these relationships and adapt their strategies accordingly. Our work inspired an improvement that Evolutionary Algorithms (EA) as an alternative approach to efficiently explore the multi-agent policy space and facilitate collaboration. Salimans et al. (2017) has shown that EA is competitive in single-agent settings. Instead of value function approximation, it allows individuals in a population to directly evolve based on fitness (i.e., accumulated payoff). We recommend using EA for policy optimization in multi-agent systems where individuals learn from uncertain environments. With small selective pressure, exploration of a wider range of strategies holds promise for guiding the collective towards cooperation.
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
5.下周目标
继续根据投稿要求进行论文格式的修改，重新插入图片表格及相关引用等，进行拼写和语法检查
6.本周收获
7.为课题组所做的服务性工作
无
2023-2024 学年第一学期 第 13 周
总 055 期 提交时间：2023年11月25日
1.本周目标
根据意见修改和完善论文
2.本周实际做的工作
(1) 摘要中dual effects出现的下一句中对其进行解释 (2) 结果部分次级标题做了修改，并参考相关文献更正了一些措辞 (3) 将讨论部分围绕四个次级标题的内容进行展开，重写了部分句子 (4) 结论部分补充了构建Agent-based Model对研究问题的作用，个体策略演化受到环境反馈，来突出环境异质性对合作演化影响的研究意义 (5) 了解目标期刊的投稿要求
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
目前了解到的目标期刊投稿格式要求信息有限，或可直接根据Elsevier官方提供的latex模板进行格式修改
5.下周目标
完成文章和参考文献编辑器配置，继续根据投稿要求进行论文格式的修改
6.本周收获
7.为课题组所做的服务性工作
整理文档及公式
2023-2024 学年第一学期 第 12 周
总 054 期 提交时间：2023年11月18日
1.本周目标
(1) 放入补充材料中的内容和图像附注有待完善 (2) 完成参考文献校对与插入 (3) 根据论文初稿的框架，整理结果对应的数据与代码
2.本周实际做的工作
(1) 完善Supplements中图表的附注与解释 (2) 校对参考文献，完成初稿写作 (3) 整理数据及代码，以及大小图片（拼接与未拼接的）到一个文件夹中
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
部分语法语义可能仍存在歧义，需要继续完善
5.下周目标
(1) 修改和完善论文初稿
6.本周收获
7.为课题组所做的服务性工作
无
2023-2024 学年第一学期 第 11 周
总 053 期 提交时间：2023年11月11日
1.本周目标
(1) 继续开展期刊论文的整理与写作
2.本周实际做的工作
(1) 继续进行段落和语句的校对，完善图表的附注与解释，修改文字细节若干，并对部分图片重新做了修饰和排版，增加可理解性 (2) 结合文章主要解决的科学问题以及已经成型的论文结构，将部分参数分析的内容调整到论文的补充材料（Supplement）中，突出文章的主要结果，即在四种情境下资源异质性对合作演化的作用
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
5.下周目标
(1) 放入补充材料中的内容和图像附注有待完善 (2) 完成参考文献校对与插入 (3) 根据论文初稿的框架，整理结果对应的数据与代码
6.本周收获
7.为课题组所做的服务性工作
无
2023-2024 学年第一学期 第 10 周
总 052 期 提交时间：2023年11月04日
1.本周目标
(1) 继续开展期刊论文的整理与写作
2.本周实际做的工作
(1) 梳理论文逻辑框架，将内容补充入相关的段落中，论文初稿基本成型 (2) 对文中部分用词进行校对和修改，保证前后一致，避免模型描述段落中的语意歧义 (3) 继续阅读相关论文，学习其写作方式
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
5.下周目标
(1) 继续进行段落和语句的校对，基本完成论文初稿的文字内容 (2) 参考相关论文，完善图表的附注与解释 (3) 适当地将部分内容调整到论文的补充材料（Supplement）中
6.本周收获
7.为课题组所做的服务性工作
无
2023-2024 学年第一学期 第 9 周
总 051 期 提交时间：2023年10月28日
1.本周目标
(1) 准备中期汇报演讲 (2) 开展期刊论文的整理与写作
2.本周实际做的工作
(1) 准备并完成中期汇报 (2) 草拟论文框架
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
答辩委员认为难以为本研究提供合适的意见，担心无法获得合格的分数，需慎重考虑
5.下周目标
(1) 完成期刊论文前言部分的写作
6.本周收获
7.为课题组所做的服务性工作
无
2023-2024 学年第一学期 第 8 周
总 050 期 提交时间：2023年10月21日
1.本周目标
(1) 改进中期汇报PPT，展示文章框架及进度
2.本周实际做的工作
(1) 根据意见改进中期汇报PPT (2) 以目前工作进度，重新整理小论文框架与结果，继续开展论文写作
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
5.下周目标
(1) 准备中期汇报演讲，如何更加清晰地表述工作思路和精炼地展示主要结果，以及可能在汇报中遇到的问题，提前准备相关答案 (2) 将假期机翻完成的小论文内容进行修改，继续开展小论文的整理与写作
6.本周收获
7.为课题组所做的服务性工作
无
2023-2024 学年第一学期 第 7 周
总 049 期 提交时间：2023年10月14日
1.本周目标
(1) 继续结合相关文献结果，完善章节讨论部分 (2) 梳理文章脉络，完成中期答辩PPT制作
2.本周实际做的工作
(1) 完善空间隔离对合作演化影响的讨论，在种群充分混合假设下，先前研究发现移动性对雪堆博弈的合作水平没有明显影响；根据移动性的分析结果，在假设移动半径为2时智能体混合均匀的条件下，当连通率为100%，且不同区域边缘个体之间的互动没有影响时，策略传播完全依赖于个体的移动和学习，暗示种群充分混合，前后一致说明模拟结果可靠 (2) 制作中期汇报PPT
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
控制中期汇报演讲时长，适当精炼主要结果
5.下周目标
(1) 改进中期汇报PPT，展示文章框架及进度
6.本周收获
7.为课题组所做的服务性工作
无
2023-2024 学年第一学期 第 6 周
总 048 期 提交时间：2023年10月07日
1.本周目标
完善空间隔离结果的分析与讨论，继续将相关内容整理成文
2.本周实际做的工作
(1) 在其他参数条件不变的条件下，对空间连通率与不同区域边缘的个体之间存在信息交互做了线性回归分析，发现种群的平均合作水平随空间连通率增加而减少，尤其是当区域边缘的个体能够进行信息和策略的交流时，平均合作水平变化更为明显 (2) 完成空间隔离部分的结果描述，整理相应的数据、代码和图片
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
近期（九月）发表的最新论文《动态网络中的策略演化》，关键词中提到了时间异质性和空间异质性，值得阅读并整理如异质性作用的文献综述中
5.下周目标
(1) 继续结合相关文献结果，完善章节讨论部分 (2) 梳理文章脉络，完成中期答辩PPT制作 (3) 阅读文献，将最新进展整理到绪论或背景部分
6.本周收获
7.为课题组所做的服务性工作
无
2023-2024 学年第一学期 第 4 周
总 047 期 提交时间：2023年9月23日
1.本周目标
(1) 继续完善空间隔离部分模拟情境的分析，处理数据并确定好比较关系 (2) 完成统计检验和结果作图，并将相关内容整理成文
2.本周实际做的工作
(1) 将空间隔离的模拟场景分为5种不同的情境：①将不存在空间隔离（Connected Landscape），即使用前文研究中使用的参数条件，作为与其他情境进行比较的Baseline；②完全隔离（Fully isolated Landscape），即空间连通率为0%，并且不同区域边缘的个体之间不能感知和学习；③空间连通率为100%，但不同区域边缘的个体之间不存在信息交互；④空间连通率为100%，且不同区域边缘的个体存在信息交互；⑤空间连通率为0%，但不同区域边缘的个体之间存在信息交互。 (2) 通过5种不同的情境之间的分析，并确定了8对比较关系，可以了解空间连通率、不同区域边缘的个体之间存在信息交互对种群平均合作水平的作用，以及进一步探讨空间隔离条件下的策略传播如何影响合作的演化。此外，从目标模拟结果可推测种群的平均合作水平随空间连通率增加而减少。
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
5.下周目标
完善空间隔离结果的分析与讨论，继续将相关内容整理成文
6.本周收获
在本章关于移动性的模拟中，可以确定移动半径为2时系统表现出种群混合均匀假设下相似的结果，经空间隔离的分析可以尝试从策略传播的角度再次印证这一描述，作为讨论的一部分。
7.为课题组所做的服务性工作
无
2023-2024 学年第一学期 第 3 周
总 046 期 提交时间：2023年9月16日
1.本周目标
(1) 将上周Sobol全局敏感性分析及移动性对合作演化作用的内容及图片整理成文 (2) 回顾移动性对合作演化的影响的相关参考文献，以完善这一部分的讨论及分析
2.本周实际做的工作
(1) 修改毕业论文提纲与进展工作文档 (2) 整理Sobol全局敏感性分析，制作Sobol指数及两两参数组合S2的结果图片 (3) 在移动半径对种群平均合作水平的影响中，以移动半径从1增加到2时对合作策略的抑制作用（即平均合作水平的减少量）为1单位，重新绘制显著水平为10%和5%时的图片 (4) 完成空间隔离对合作演化影响的模拟，获得原始数据，并进行简单分析
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
5.下周目标
(1) 继续完善空间隔离部分模拟情境的分析，处理数据并确定好比较关系 (2) 完成统计检验和结果作图，并将相关内容整理成文
6.本周收获
相关研究中所指的是移动性，通常是探讨空间博弈中移动能力的有无对合作演化的作用，虽然与我们模型中对移动半径的讨论并不是完全相同的概念，但对合作行为的影响表现出相似的作用，即较弱的移动性可能是合作得以维持的机制。
7.为课题组所做的服务性工作
无
2023-2024 学年第一学期 第 2 周
总 045 期 提交时间：2023年9月9日
1.本周目标
(1) 调试第三部分空间隔离中sobol采样和模型运行的程序代码 (2) 继续完善移动性对合作演化作用的图片及结论
2.本周实际做的工作
(1) 通过Python的SALib库和pynetlogo库进行模型的Sobol全局敏感性分析。分析参数包括以下7个：种群密度（population density）、初始合作水平（initial Cooperate ratio）、移动半径（move radius）、资源多度（resource abundance）、资源再生周期（growing period）、空间连通率（region connectivity）以及从区域外智能体学习（learn from foreigner）。 (2) 对分析结果进行绘图和总结：种群密度（population density）、资源多度（resource abundance）、资源再生周期（growing period）对模型输出的变异起主要作用。两个因空间隔离的设计而引入的参数——令个体感知邻近区域邻居的信息并模仿其策略的开关（learn from foreigner）和空间连通率（region connectivity），一阶Sobol指数（S1）接近于0，暗示较低的相对重要性，但ST指数与S1指数的差异显示这些参数不可忽视的相互作用。
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
5.下周目标
(1) 将本周Sobol全局敏感性分析及移动性对合作演化作用的内容及图片整理成文 (2) 回顾移动性对合作演化的影响的相关参考文献，以完善这一部分的讨论及分析
6.本周收获
7.为课题组所做的服务性工作
无
2022-2023 学年第二学期 第 17 周
总 044 期 提交时间：2023年6月24日
1.本周目标
(1) 学习敏感性分析方法 (2) 继续翻译和修改论文，思考种群策略频率变化的指标的量化和分析
2.本周实际做的工作
(1) 阅读文献（Thiele2014）中介绍的敏感性分析方法
(2) 学习 r 包 sensitivity，全局敏感性分析中模拟实验的采样方法（超拉丁方采样等），了解 sobol 方法的设计原理、如何确定重复样本数量、以及分析结果的解释等
(3) 学习如何在 R 语言环境中使用 RNetLogo 和 nlrx 调用和运行 NetLogo 模型
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
基本完成
4.如何改进
由于NetLogo 中的 Behavior Space 无法直接完成全局敏感性分析的实验设计，有必要使用其他程序进行模型的设置和运行：
RNetLogo 多年未获得维护更新（17年至今），存在版本不兼容的问题，不支持新版的 NetLogo.jar 程序，若使用旧版 NetLogo（6.0以前的版本）需要对原模型代码进行调整，且在计算速度慢，运行步数和模拟时间上限上限（受源程序使用的java版本影响）较低；nlrx 则是通过系统命令行直接调用 NetLogo 相关程序和配置好的 XML 来完成模拟，但每次执行将重新打开和配置一遍 NetLogo 程序，启动过程耗时较长，将大大增加运行时间成本；目前考虑使用 Python 来完成模型的调用和敏感性分析。
粗略估计，使用 nlrx 进行一次sobol全局敏感性分析大约需要连续运行 120 个小时以上。由于重复样本数量未确定，应通过多次测试已获得收敛（或误差范围较小）的 sobol 指数，预计将花费更长时间完成相关工作；
根据论文（Thiele2014）原文3.54 “It is always a good idea to start with a graphical method, e.g., scatterplots, to obtain a rough feeling for the relationships of inputs and outputs and their linearity or non-linearity. In a next step, one can, for example, use Morris’s elementary effects screening to identify the most important factors and apply the Sobol’ method afterwards to these factors” 在初步了解参数对模型输出的影响后，先使用 Morris 的过滤方法，减少 Sobol 分析中的参数数量，可以降低计算和时间成本。
5.下周目标
(1) 学习三个 Python 库的使用 ① pynetlogo 调用和运行模型，② SALib 敏感性分析、③ ipyparallel 并行计算
(2) 编写相关模拟程序
(3) 继续了解文中其他全局敏感性分析方法
6.本周收获
见 2、4
7.为课题组所做的服务性工作
无
2022-2023 学年第二学期 第 16 周
总 043 期 提交时间：2023年6月17日
1.本周目标
(1) 翻译论文，对需要重新绘制的图片和图表名称进行修改（英文标签），完善删改后参考文献的插入 (2) 继续后续研究的实验设计与模拟
2.本周实际做的工作
(1) 翻译并修改论文引言，增删参考文献的插入 (2) 整理作图数据及代码，完成英文标签等修改 (3) 学习相关文献中敏感性分析如何写
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
部分完成。疑似手机或手机卡坏了，网络异常，日常生活影响较大
4.如何改进
5.下周目标
(1) 继续翻译和修改论文 (2) 思考和设计量化种群策略频率变化的指标，并考虑做进一步的分析比较
6.本周收获
在相关文献中，研究者倾向于先进行理论分析，然后使用cellular automation（或被作者称为individual-baesd model）进行模拟，该类文章中通常不涉及敏感性分析。直接使用agent-based model模拟不同策略重复博弈的研究中，仅有少数对模型进行了敏感性分析（即根据研究内容确定关心的模型输出，重复模拟和计算不同参数范围/组合下的均值和方差），且一般来自于常用ABM进行其他方向和场景的研究者。一般认为，在模拟演化时受随机性和相互作用的影响，许多因素和参数组合都将造成演化结果的不同。从研究目的出发，可以使我们更好地确定模型输出会因为哪些感兴趣的影响因素而改变，从而判断结论是否稳定可靠。
7.为课题组所做的服务性工作
无
2022-2023 学年第二学期 第 15 周
总 042 期 提交时间：2023年6月10日
1.本周目标
继续修改论文，完善讨论
2.本周实际做的工作
(1) 参照英文文献的文章结构，对论文各部分内容的编排进行调整，将更新规则调整和参数分析作为<模型与方法>的一部分，一些相关内容整理放入<讨论>中，包括模型输出分析指标的权衡、随机演化动力调整的动机和细节解释等；<讨论>部分增加了与本研究中其他发现和展望有关的讨论和参考文献，包括资源的不确定性和个体的移动性等研究；添加了<结论>部分，总结研究发现及意义 (2) 对第三部分（移动性和空间隔离）的参数分析做了设计与模拟，并结合先前的数据进行了整理与分析，测试在本模型设定的空间规模中，移动半径增大到什么水平时与假设种群充分混合的研究发现基本一致，与相关文献形成呼应，确保正确合理地开展下一步研究和分析
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
在阅读文献和修改文章时，发觉中英文的语言逻辑存在一定差异。若文章结构和篇幅安排合适，可先完成机器翻译后再继续进行修改，也有利于引言部分的段落逻辑的把握和调整
5.下周目标
(1) 翻译论文，对需要重新绘制的图片和图表名称进行修改（英文标签），完善删改后参考文献的插入 (2) 继续后续研究的实验设计与模拟
6.本周收获
本周除毕业论文的研究工作外，选修了高级计量经济学的海外课程研修（经济统计中的效率分析和因果推断方法：随机前沿和双重差分等）
7.为课题组所做的服务性工作
无
2022-2023 学年第二学期 第 14 周
总 041 期 提交时间：2023年6月3日
1.本周目标
根据修改意见，对论文初稿进行修改
2.本周实际做的工作
对论文初稿的修改内容如下： (1) 引言：对各段落中语言逻辑进行了调整 (2) 模型参数化：语言和表达更加精炼，删减了部分图片及叙述（暂放入附录） (3) 结果：将模型运行整合到结果中，并为种群频率变化增加了个体平均变化数量和平均变化率的量化参考指标（情境描述与分析待加入） (4) 结论：对异质性双重作用所对应的条件做了更加具体明确的叙述 (5) 讨论：对模型涉及，但未在本研究中有重要体现的参数做了介绍（为何会被考虑）；根据模拟结果中的部分发现，对后续可能的研究方向进行了展望；指出本文研究尚未考虑到的主观异质性作用，移动作为个体的主观属性，在动态环境的合作演化中有重要作用，值得探讨。
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
基本完成
4.如何改进
从已读的英文文献中寻找更多值得与本文一起讨论的相关内容，学习各部分结构的写作逻辑
5.下周目标
继续修改论文，完善讨论
6.本周收获
7.为课题组所做的服务性工作
无
2022-2023 学年第二学期 第 13 周
总 040 期 提交时间：2023年5月27日
1.本周目标
(1) 继续小论文初稿的攥写 (2) 完成引言部分参考文献的整理
2.本周实际做的工作
完成小论文初稿的攥写
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
文中图片尚未进行更加规范的整合，方便根据意见再做调整和修改
5.下周目标
回到空间隔离部分的模型研究工作，继续数据整理和模拟实验的设计。根据前两部分结构安排的经验，对参数分析和模型实验的思路重新进行梳理，设计更加科学的模拟和分析过程，并为该部分的研究内容思考合适的引言衔接，使毕业论文三个部分的研究内容更加具有联系性和逻辑性。
6.本周收获
本周针对论文中的一些表达和措辞与同学进行了讨论交流，有助于更好地向并不熟悉该研究方向的对象阐述和解释相关内容。
7.为课题组所做的服务性工作
无
2022-2023 学年第二学期 第 12 周
总 039 期 提交时间：2023年5月20日
1.本周目标
(1) 将第二部分的模拟实验和分析结果进行讨论和解释，完成第二部分初稿的收尾 (2) 补充完成前言的内容（绪论和相关理论方面），并自己从头阅读和修改
2.本周实际做的工作
(1) 完成章节第二部分研究内容的写作 (2) 梳理引言部分段落之间的思路，调整语序使逻辑更合理，引用文献待重新整理 (3) 参考相关文献，将目前完成的写作内容整合为更加适合期刊论文的语言和形式，列出了论文目录和框架
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
5.下周目标
(1) 继续小论文初稿的攥写 (2) 完成引言部分参考文献的整理和校对
6.本周收获
本周旁观了硕士研究生答辩，对毕业论文要求有了进一步的了解。
7.为课题组所做的服务性工作
无
2022-2023 学年第二学期 第 11 周
总 038 期 提交时间：2023年5月13日
1.本周目标
继续完善第二部分的作图和分析的工作，基本完成本节内容的写作
2.本周实际做的工作
(1) 对淘汰率进行取值区间更广的模型参数分析，模拟和分析数据：在较低淘汰率和较高的淘汰率的条件下，系统的合作水平变化不同，将参数分析的部分整理为适合论文的章节 (2) 进一步发现淘汰率的高低可能会影响异质性作用：在异质性作用的模拟实验部分上，以较高/低的淘汰率水平的参数设置展开讨论 (3) 除部分图表外，基本完成本节的文字写作
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
暂时初稿先按照学位论文的写法，尽可能详细的介绍和阐述，后续再以期刊论文所关注的问题提炼起来也较为方便
5.下周目标
(1) 将第二部分的模拟实验和分析结果进行讨论和解释，完成第二部分初稿的收尾 (2) 补充完成前言的内容（绪论和相关理论方面），并自己从头阅读和修改
6.本周收获
为异质性的双重作用找到一个相对合理的解释：先前的研究认为影响合作演化关键在于异质性改变了个体采取某种策略的概率，基于模拟实验的结果，猜想个体策略调整后，不同的纯策略所占比例变化可能在异质性作用中扮演了更重要的角色。
7.为课题组所做的服务性工作
无
2022-2023 学年第二学期 第 10 周
总 037 期 提交时间：2023年5月6日
1.本周目标
继续论文的阅读与写作
2.本周实际做的工作
(1) 根据前一周拟定的科学问题，开展第二部分的写作。按照模型介绍、模型运行和参数分析、模拟实验的顺序，完成第二部分约2/5的内容（正文写作、图表等） (2) 参考相关研究的学位论文，写了一部分绪论以及相关理论的内容，主要是对开题时的研究意义和研究框架重新进行梳理
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
预计5月中旬回校后，再对细节进行交流
5.下周目标
继续完善第二部分的作图和分析的工作，基本完成本节内容的写作。或至少完成约2/3的内容，本月中能将本节内容完成收尾。
6.本周收获
在基于Moran过程的替代更新模型中淘汰率参数的调整有一些新发现，可能有利于解释资源异质性对合作演化的双重作用，具体的需要在下周工作中进一步模拟和分析
7.为课题组所做的服务性工作
无
2022-2023 学年第二学期 第 8 周
总 036 期 提交时间：2023年4月22日
1.本周目标
(1) 继续完善"资源分布"模型的章节内容，基本完成这一部分的写作内容 (2) 参考其他论文对模型模拟过程的介绍，为第二部分"不同更新方式"模型改写一版模型介绍作为比较
2.本周实际做的工作
(1) “资源分布"模型的完善了模型运行过程的描述和解释，补充实验结果、稳健性分析和具体平均合作水平的统计检验表格等，基本完成这一部分的写作内容 (2) 修改了"不同更新方式"模型的写作思路，将这部分研究问题确定为"智能体策略更新方式的变化是否会影响资源分布对合作演化的作用”，以更加科学的方式表达为，博弈主体的主观变化是否会影响互动环境的客观异质性对合作演化的作用 (3) 浏览了一些异质性对合作演化影响的文章，以及阅读了一篇随机演化动态综述
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
5.下周目标
继续论文的阅读与写作，根据章节内容需要完善一些数据整理、作图和分析的工作
6.本周收获
(1) 在异质性对合作演化影响的文章中学习到，异质性从智能体的角度，可以分为主观异质性和客观异质性，该观点对拟定"不同更新方式"模型的科学问题很有帮助。 (2) 从随机演化动态的文献中了解到，成对比较或模仿更新可以统称为Fermi过程，并学习了一些随机演化过程中专业度量术语。
7.为课题组所做的服务性工作
无
2022-2023 学年第二学期 第 7 周
总 035 期 提交时间：2023年4月15日
1.本周目标
(1) 继续模拟实验的相关工作 (2) 学习相关写作规范，拟写出论文需要涉及的内容大纲 (3) 继续 ODD 协议的写作，开始把前面的一部分结果总结为文字材料，利用原始数据重新作图等
2.本周实际做的工作
(1) 继续编写"不同更新方式"模型的 ODD 协议，暂时删减了大量与"资源分布"模型重复或相似的内容，以介绍如何实现近似的 Moran 过程为主 (2) 学习了其他文章中对合作演化分析的方式（固定概率），可能对改进"不同更新方式"模型有一些帮助 (3) 完善了模型相关的各章节目录，“资源分布"模型的章节内容新增了的模型分析和部分实验结果 (4) “资源分布"模型涉及的原始数据重新用R进行分析，绘制适合论文的频率分布图、散点图、箱型图等，300 dpi保存
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
(1) 随着实习工作的熟悉，后续将根据工作安排适当调整每周研究任务以模拟分析还是阅读写作为主。现计划在手头数据分析和文字整理完成前，暂不继续进行更多试验模拟 (2) 由于从第二部分模型开始， ODD 协议中存在较多重复相似内容，是否需要在论文中提供较为完整的 ODD 协议值得考虑。目前认为，可以参考其他论文的模型介绍，改写一个版本作为比较
5.下周目标
(1) 继续完善"资源分布"模型的章节内容，基本完成这一部分的写作内容 (2) 参考其他论文对模型模拟过程的介绍，为第二部分"不同更新方式"模型改写一版模型介绍作为比较
6.本周收获
在之前的模拟结果中介绍过，“累积能量"模型可能出现合作策略占优势，甚至取代竞争策略的情况，适合使用固定概率进行分析和讨论。
7.为课题组所做的服务性工作
无
2022-2023 学年第二学期 第 6 周
总 034 期 提交时间：2023年4月8日
1.本周目标
(1) 对近期的数据和结果进行记录和整理，开始编写第二部分模型的 ODD 协议 (2) 继续不同连通度参数相关试验的分析讨论，对从邻近区域个体感知信息和学习的情境进行试模拟
2.本周实际做的工作
(1) 优化了模型中一些重复代码，添加注释；模型界面增加了随机数种子，方便复现 (2) 在整理数据同时，对之前一些结果增加了不同随机数种子的测试 (3) 继续写"不同更新方式"模型的 ODD 协议 (4) 对从邻近区域个体感知信息和学习的情境进行模拟，计划结合随机数种子的测试后再将数据一起进行分析
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
前面工作获得的结果未考虑到随机数种子对模型输出敏感性的问题，可以适当补充一些模拟数据；除了 ODD 协议，尚未对其他相关的写作规范进行学习。
5.下周目标
(1) 继续模拟实验的相关工作 (2) 学习相关写作规范，拟写出论文需要涉及的内容大纲 (3) 继续 ODD 协议的写作，开始把前面的一部分结果总结为文字材料，利用原始数据重新作图等
6.本周收获
在本周的模拟实验中，发现使用部分随机数种子出现的结果与重复实验获得的结论不一致。在之前的工作中，虽然也注意到一些异常的小概率事件，但对随机数种子对模型输出敏感性未能充分地重视，可能会影响到模型获得稳定、可复现的结果。对于模拟结果的稳健性而言，除了使用统计方法对随机模拟结果的显著性进行检验以外，还可以尝试使用多个不同的随机数种子，并比较统计指标的平均值和方差。
7.为课题组所做的服务性工作
无
2022-2023 学年第二学期 第 5 周
总 033 期 提交时间：2023年4月1日
1.本周目标
(1) 对资源分布随机化的两种形式进行比较，确保不会与前面的研究结论有所冲突 (2) 继续空间隔离的相关试验设计和模拟，以连通度参数的影响为主要研究内容
2.本周实际做的工作
(1) 比较资源分布随机化的不同形式下模型的运行情况，与原模型中的 ①重置为随机值 相比，在修改后的 ②重置为初始值 的条件下可以观察到平均合作者水平略有降低，但不会对稳定均衡有明显影响 (2) 对上周编程中模型存在的问题进行了优化和调整，界面增加相关选择器，方便使用行为空间进行调试 (3) 在资源分布模型的初始化参数条件下，模拟了不同连通度参数的空间隔离场景
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
近两周的工作内容集中于试验设计和模拟分析，部分数据和结果未及时完成整理和记录，可以适当跟进 ODD 协议等文字工作
5.下周目标
(1) 对近期的数据和结果进行记录和整理，开始编写第二部分模型的 ODD 协议 (2) 继续不同连通度参数相关试验的分析讨论，对从邻近区域个体感知信息和学习的情境进行试模拟
6.本周收获
在连通度减小的模拟试验中，观察到模拟终止步数的增加，即空间隔离程度增加似乎对合作的演化有利。以平均合作者水平作为统计指标，对连通度参数试验继续进行模拟和分析，从试模拟的运行过程观察，完全隔离的条件下（连通度为0时）模型表现似乎有所不同
7.为课题组所做的服务性工作
无
2022-2023 学年第二学期 第 4 周
总 032 期 提交时间：2023年3月25日
1.本周目标
(1) 完成移动性相关试验部分的整理和记录 (2) 进行空间隔离（即一定程度上的移动限制）的相关试验设计，调试参数，并在试模拟中获得部分假定结论
2.本周实际做的工作
(1) 根据移动性相关模拟试验的结果，对移动范围类型、移动半径等在模型中的作用进行了整理和记录 (2) 完成空间隔离的初步模拟，比较了是否存在空间隔离时模型差异，当连通度参数为1，且不能感知和学习到其他邻近区域智能体的收益和策略时（即完全隔离），可能对合作演化不利 (3) 在模型中，增加了资源分布随机化的另一种形式，使模型可以在setup时确定空间单元上的资源初始值，到达每一个资源再生周期的步数时，恢复到初始值（而不是重新由随机化程序指定），有利于模拟环境的确定性，更为合理地满足部分研究内容的需要，也可视为资源分布模型的稳健性分析
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
空间隔离模型中，使用"本周工作(3)“中的资源分布随机化形式似乎更加合理。目前编程已修改完成，可在后续试验中关注是否有显著影响。
5.下周目标
(1) 对资源分布随机化的两种形式进行比较，确保不会与前面的研究结论有所冲突 (2) 继续空间隔离的相关试验设计和模拟，以连通度参数的影响为主要研究内容
6.本周收获
当模型存在空间隔离时（以完全隔离为例），从输出图像观察，总体累积能量的平均值的表现明显不同。其中，合作者平均能量明显高于竞争者，演化似乎出现对合作有利的局面。事实上，因为部分区域内幸存合作者的数量较多，他们之间的相互租用有利于能量的累积，从总体水平上看，与之比较的个体包含来自大多数已出现稳定均衡的其他区域的竞争者。此时的非合作策略仍是系统中智能体的偏好策略，虽然造成竞争损失的个体拉低了平均能量水平，但在合作者幸存区域内的竞争者仍然可以利用合作者获得更多资源。因此，空间隔离虽然起到了防止竞争者入侵和利用合作者的作用，但也不利于合作策略的扩散和传播，故连通度和是否可以感知和学习其他邻近区域的智能体的收益和策略可能有重要作用。
7.为课题组所做的服务性工作
无
2022-2023 学年第二学期 第 3 周
总 031 期 提交时间：2023年3月18日
1.本周目标
(1) 增加重复实验的模拟次数，对移动范围较大时的结论做进一步探究 (2) 相关结论在不同环境条件下的稳定性分析，整理数据与结果 (3) 继续完善"基本模型” ODD 协议中的表格内容
2.本周实际做的工作
(1) 重新对移动性相关试验部分的环境条件参数进行调试，使模拟结果方便从平均合作者水平和模拟终止步数的结果作为参考 (2) 以Von Neumann类型，移动半径较大（move radius = 3 和 4）的条件，进行重复模拟试验。半径增大后，平均合作者水平仍略有降低，但模拟步数上无明显差异，与相关研究结果基本一致
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
移动性相关试验部分基本完成，结果分析上还需借鉴其他文献进行讨论
5.下周目标
(1) 完成移动性相关试验部分的整理记录 (2) 进行空间隔离（即一定程度上的移动限制）的相关试验设计，调试参数，并在试模拟中获得部分假定结论
6.本周收获
(1) 学习了相关论文中移动性双重作用的体现及形成原因。在几种经典博弈中移动性的影响略有不同，当种群充分混合时，移动对鹰鸽博弈的合作水平几乎没有影响 (2) 由于论文中提到移动性作用的原因与策略调整有关，预测近似Moran过程的更新方式下移动对合作的不利影响较小（该想法与目前计划内的后续研究内容关系不大，可在时间有余时进行试模拟） (3) 在本模型的移动性相关试验部分中，Von Neumann类型与Moore类型的不同体现在可移动范围的增大，其效果与移动半径增加基本相同。在Von Neumann类型的条件下，随着移动半径增大（≥4），在本模型设定的空间规模中与充分混合基本一致
7.为课题组所做的服务性工作
无
8.近期工作中的问题
试验的设计和模拟上已有较为成型的思路，但部分结果仍未能给出较有说服力的解释，可能会影响后续的论文写作和答辩汇报等工作，近期将花时间在文献阅读上，相关研究论文的写作规范也需要学习
2022-2023 学年第二学期 第 2 周
总 030 期 提交时间：2023年3月11日
1.本周目标
(1) 按照改进内容进行试模拟，设计重复实验，整理数据与结果 (2) 继续 ODD 协议的修改与写作
2.本周实际做的工作
(1) 继续进行与移动性参数有关的试模拟： (2) 对"个体移动可以停留在原来位置不利于合作的演化"这一结论做了进一步的稳健性分析：在①不同的移动半径，和②不同的移动范围类型（Von Neumann型或Moore型）的条件下均成立； (3) 对移动半径和移动范围类型的影响进行试验：移动范围的增加可能对合作策略不利，但移动半径较大时（≥3），影响减小，可能意味着双重作用的出现。 (4) 修改了"基本模型” ODD 协议中内容若干
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
本周所进行的一些试验，重复次数仍较少，移动半径增加后对合作演化的相关结论还有待检验。此外，可能还需考虑环境条件设置的影响，进行不同环境条件的稳健性分析。
5.下周目标
(1) 增加重复实验的模拟次数，对移动范围较大时的结论做进一步探究 (2) 相关结论在不同环境条件下的稳定性分析，整理数据与结果 (3) 继续完善"基本模型” ODD 协议中的表格内容和文档排版
6.本周收获
继续学习2020年版的ODD协议（论文补充材料所提供的示例），对"子模型”（submodel）一节更多的认识
7.为课题组所做的服务性工作
无
2022-2023 学年第二学期 第 1 周
总 029 期 提交时间：2023年3月4日
1.本周目标
(1) 整理和备份组会上汇报内容的数据及结果 (2) 继续"空间隔离的合作演化模型"的试模拟 (3) 继续"资源分布基本模型"、“累积能量模型”、“近似Moran过程"等 ODD 协议的修改和写作
2.本周实际做的工作
(1) 整理和备份数据，修改"资源分布基本模型"ODD中的部分内容 (2) 继续"空间隔离模型"的试模拟，从移动性上比较不同参数条件下的结果。在个体移动可以停留在原来位置的情况下，对合作可能有抑制作用。 (3) 阅读了一篇"移动性对合作演化影响"的中文硕士论文
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
个体移动是模型中智能体适应性的表现之一，当每轮博弈结束后，所处位置上资源被相应的消耗。与随机移动到邻近空间单元相比，在对环境资源未知的隐含假设下，可以留在原地的移动方式更加保守。前者认为所处位置资源消耗后，离开当前位置更有可能移动到可以获得资源，而后者实际上倾向于认为当前位置的资源存量仍然可以维持其的能量需要。所以，在资源生长率较高的条件下，或许两者的表现又会出现不同。
5.下周目标
(1) 按照第4点中的改进内容进行试模拟，设计重复实验，整理数据与结果 (2) 继续 ODD 协议的修改与写作
6.本周收获
移动性对合作演化的影响有双重作用，因此在本模型中获得相应结论，对后续研究的可靠性有重要作用。
7.为课题组所做的服务性工作
无
8.本学期目标
(1) 完成全部 ODD 协议的修改与写作（期刊论文和毕业论文都可以使用到的文字材料） (2) 根据组会汇报"空间隔离模型"相关的工作安排，完成后续的模型设计和实验模拟，整理数据与结果 (3) 将"资源分布基本模型”、“累积能量模型”、“近似Moran过程"中获得的不同影响的内容进行整合，作为期刊论文的写作内容。按照框架逐步整理内容填充，争取进行初稿的拟写 (4) 其他个人工作计划：准备语言考试、实习
2022-2023 学年第一学期 第 16 周
总 028 期 提交时间：2022年12月17日
1.本周目标
(1) 完善当前模型的编程和调试，并对α随机化后的演化过程进行初步地观察比较 (2) 为系统设置一定的淘汰率，并用与Moran过程类似的个体更替方式，尝试为模型增加一种新的策略更新机制（不根据邻居的信息进行模仿学习） (3) 通过进一步调试，保证模型的运行符合理论预期，即新的演化方式与原更新机制在策略演化的模拟结果一致
2.本周实际做的工作
(1) 对模型中α进行随机化：通过random-float α处理时，可能出现α为0的特殊情况（此时无论个体累积能量多少，繁殖的可能性都为0），模型出错无法继续运行。目前使用while语句进行判断，在α为0时重新随机化处理。此外，经推理和编程调试，random-poisson或者random-normal等分布的处理也有类似问题出现 (2) 在为系统设置淘汰率后，为模型建立了近似Moran过程的个体更替方式，通过典型的灭生过程，对系统中的策略进行更新。经模拟和测试后，在一定的参数条件下可以实现和模仿邻居类似的演化结果
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
考虑到对α随机化时可能出现的特殊情况，且在模拟测试中似乎对演化的影响较小，该方向的进一步尝试先暂时保留
5.下周目标
(1) 校验模型代码，注释近期编写的新代码段，及时完善现模型的记录和描述等 (2) 灭生过程的更新方式下，测试因系统淘汰率而死亡的个体与能量耗尽死亡的个体同时起作用时是否出现冲突，并对参数条件和演化结果做进一步分析
6.本周收获
7.为课题组所做的服务性工作
无
2022-2023 学年第一学期 第 15 周
总 027 期 提交时间：2022年12月10日
1.本周目标
(1) 学习演化博弈理论中强选择和弱选择的内容 (2) 查找是否有对选择强度有所体现的相关模型 (3) 继续对个体繁殖的可能性与累积能量联系的部分进行编程和调试
2.本周实际做的工作
(1) 通过网络和文献了解选择强度的相关理论，但目前尚未查找到相关的ABM（可能是相关模型未在描述上体现导致不易搜索） (2) 根据从选择强度理论获得的启发，在每个时间步内，将内定的参数α进行标准化处理：在个体累积能量对适合度的贡献较大的条件下，令当前系统中能量最大的个体，根据α×(个体收益/100)所计算繁殖率为100%，保证个体的繁殖率（适合度）与累积能量相关，也避免模型中出现上周调试过程中的崩溃现象 (3) 在(2)的修改上，若考虑每个时间步（演化世代）内，个体累积能量对适合度的贡献可能不同，可以假设标准化后的α服从某一分布，增加系统演化过程的随机性
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
本周工作(3)的想法仍在模拟测试和比较。此外，在学习演化博弈理论的过程中，对Moran过程在模型中的使用形成了一定思路
5.下周目标
(1) 完善当前模型的编程和调试，并对α随机化后的演化过程进行初步地观察比较 (2) 为系统设置一定的淘汰率，并用与Moran过程类似的个体更替方式，尝试为模型增加一种新的策略更新机制（不根据邻居的信息进行模仿学习） (3) 通过进一步调试，保证模型的运行符合理论预期，即新的演化方式与原更新机制在策略演化的模拟结果一致
6.本周收获
7.为课题组所做的服务性工作
无
2022-2023 学年第一学期 第 14 周
总 026 期 提交时间：2022年12月3日
1.本周目标
(1) 准备和练习开题报告，完成汇报，并根据意见进行修改 (2) 继续阅读相关文献和模型，学习如何在编程中实现个体繁殖的可能性与个体收益的联系，完成编程和调试，并比较与现模型表现有何不同
2.本周实际做的工作
(1) 准备了开题汇报可能被提问的问题：创新点、与生物统计学有何关系、纳什均衡的定义、模型细节和参数等 (2) 借鉴其他模型的方法，通过设置一个内定的参数α，根据α×(个体收益/100)来计算繁殖率，使个体繁殖的可能性与博弈得分关联。然而，现模型中若将个体累积能量作为收益，模型运行初期累积能量少，此时若α设置较小，根据α×(累积能量/100)计算的繁殖率很低，无法实现对死亡个体的补偿。若对各参数相应的进行重新调整，或者令模型能够运行一定时间后，个体累计能量较高，则可能出现所有个体繁殖的可能性都大于1的情况，个体繁殖数量激增后，环境中资源被迅速获取，不足以提供较多个体的生存，导致崩溃。该部分思路尚未完全理清，故相关内容仍需调试和探索。
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
基本完成。流感，精神体力不佳。
4.如何改进
个体繁殖的问题或许可从选择强度的方面思考解决，需进一步学习
5.下周目标
(1) 学习演化博弈理论中强选择和弱选择的内容 (2) 查找是否有对选择强度有所体现的相关模型 (3) 继续对个体繁殖的可能性与累积能量联系的部分进行编程和调试
6.本周收获
对本次开题汇报的结构安排和演讲上所存在的问题有了深刻的认识
7.为课题组所做的服务性工作
无
2022-2023 学年第一学期 第 13 周
总 025 期 提交时间：2022年11月26日
1.本周目标
(1) 进一步调试个体在每个时间步内消耗能量的具体数值 (2) 阅读相关论文和模型中对个体死亡和繁殖等内容的设定或代码 (3) 尝试对繁殖过程进行编程和调试，对个体死亡进行适当地补偿，避免在能量有效累积前耗尽，导致群体崩溃，从而可以从模拟中观察到较为合理的策略演化过程
2.本周实际做的工作
(1) 模拟能量耗尽后个体从环境中死亡的情况，利用行为空间调试对每个时间步内消耗能量进行了调试，发现在不同策略更新规则的情况下，该数值的影响程度不同 (2) 通过文献及相关模型，暂定使个体按照一定的出生率进行繁殖，以补偿能量耗尽后死亡的个体。作为代价，父代个体需要将一半的能量给予子代个体，同时也保证了子代个体与其他个体在累积能量上的可比性 (3) 完成编程后，经模拟发现模型停止的步数较之前稍有变化，合作的演化过程可能略有不同，仍需进一步模拟和分析
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
目前模型中个体按照一致的出生率进行繁殖，若要使繁殖的可能性（适应度）与累积能量（博弈得分）之间具有一定的相关性，还可以继续对个体繁殖的程序进行改进和细化
5.下周目标
(1) 准备和练习开题报告，完成汇报，并根据意见进行修改 (2) 继续阅读相关文献和模型，学习如何在编程中实现个体繁殖的可能性与博弈得分的联系，完成编程和调试，并比较与现模型表现有何不同
6.本周收获
(1) 练习了 Netlogo 中的行为空间功能的使用 (2) 了解如何使基于智能体的合作演化模型中个体合理地消耗能量进行繁殖
7.为课题组所做的服务性工作
无
2022-2023 学年第一学期 第 12 周
总 024 期 提交时间：2022年11月19日
1.本周目标
(1) 比较博弈个体模仿累积能量最大的邻居进行策略更新的结果与原策略更新规则的不同 (2) 考虑为随机移动设置一定的成本，个体在消耗能量后可能在环境中死亡的情况
2.本周实际做的工作
(1) 将个体更新策略的规则改写为模仿累积能量最大的邻居，与原策略更新规则比较后发现，模仿累积能量最大的邻居对合作行为可能有促进作用，与预期相符。在界面上添加了选择器，使模型可以选择模仿策略时参考的"信息”。 (2) 考虑个体在每个时间步内需要消耗一定能量的情况，能量耗尽后个体从环境中死亡。经测试后发现，当能量消耗太高时，在环境资源降低到可能出现合作策略之前，多数个体已经面临能量耗尽并死亡的危险。随着个体数量快速下降，导致策略趋同，模型运行结束。
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
当能量消耗数值太小时，该参数在模型演化过程中几乎不起作用，故个体在每个时间步内消耗能量的具体数值有待进一步调试。此外，可以考虑通过增加繁殖的程序，对个体死亡进行适当地补偿
5.下周目标
(1) 进一步调试个体在每个时间步内消耗能量的具体数值 (2) 阅读相关论文和模型中对个体死亡和繁殖等内容的设定或代码，可能需要解决的问题包括：①需要消耗的能量、②是否通过死亡率或出生率控制、③如何使个体繁殖的机会与博弈得分联系起来、④新个体在模型中的各项参数和其他个体是否具备可比性等 (3) 尝试对繁殖过程进行编程和调试，对个体死亡进行适当地补偿，避免在能量有效累积前耗尽，导致群体崩溃，从而可以从模拟中观察到较为合理的策略演化过程
6.本周收获
在上周的模型版本中，通过对相互竞争的得分调整，实现了策略选择可能随环境资源的消耗而改变。在环境反馈的基础上，通过能量消耗和繁殖补偿可以让环境资源对种群发挥一定的动力学作用，使模型更加符合演化的生态情境。
7.为课题组所做的服务性工作
无
2022-2023 学年第一学期 第 11 周
总 023 期 提交时间：2022年11月12日
1.本周目标
(1) 给博弈双方都是竞争者的博弈设置竞争成本，使模型可以通过控制竞争成本对支付矩阵进行调整 (2) 考虑将模型中个体的随机移动，修改为每次移动到patch中间，简化掉移动行为中对博弈对象匹配和博弈得分等都无关的过程，将模型运行的研究重点放在资源分布上
2.本周实际做的工作
(1) 修改了双方竞争的博弈得分规则：
不获得能量，资源不变→分别获得 (共同开发的总资源 - 竞争成本)÷2 的能量
(2) 简化移动行为中对博弈对象匹配和博弈得分无关的过程，并使模型初始化时个体位于patch中间，随后每次都在Von Neumann邻居上neighbors4移动
(3) 修改后模拟发现，在极少数情况下，当所有个体都处于空patch的Von Neumann邻居时，将不再能够在移动后找到可以匹配并进行博弈的其他个体（都为空），故决定将简化后的随机移动设置为：在Moore邻居neighbors上移动
(4) 优化模型，将原模型中resource-at-next-tick的变量删除，仅通过resource变量实现环境资源的消耗和更新，使模型运行更加合理
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
5.下周目标
(1) 比较博弈个体模仿累积能量最大的邻居进行策略更新的结果与原策略更新规则的不同 (2) 考虑为随机移动设置一定的成本，个体在消耗能量后可能在环境中死亡的情况
6.本周收获
(1) 在理论学习中，对从支付矩阵进行纳什均衡的分析有了进一步的了解 (2) 通过设置竞争成本，当模型竞争成本大于竞争者共同开发的总资源时，可以将博弈类型修改为雪堆博弈。此时模型存在多重纳什均衡，更容易出现合作行为，有利于通过合作者数量变化观察是否被促进或抑制 (3) 完成了博弈后资源消耗和环境资源更新的细节的修改，使模型运行更加合理
7.为课题组所做的服务性工作
无
2022-2023 学年第一学期 第 10 周
总 022 期 提交时间：2022年11月05日
1.本周目标
(1) 准备和进行开题报告的试讲，并根据意见进行调整与修改 (2) 根据上周考虑加入到模型中的新假设，进行编程和调试，比较运行结果是否合理，并及时完善注释和修改记录
2.本周实际做的工作
(1) 修改和调整了PPT字数和字体，并将演讲文稿拟写出来，方便练习演讲 (2) 根据每个个体在一个时间步内能获取一单位的资源的假设，重新进行编程 (3) 考虑对竞争策略的得分进行调整，使其也能获得一定的资源，更符合囚徒困境支付矩阵的理论条件（T>R>P>S，且2R>T+S 或 2R>2P）
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
博弈后资源消耗和环境资源更新的细节仍需要修改
5.下周目标
(1) 给博弈双方都是竞争者的博弈设置竞争成本，使模型可以通过控制竞争成本对支付矩阵进行调整 (2) 考虑将模型中个体的随机移动，修改为每次移动到patch中间，简化掉移动行为中对博弈对象匹配和博弈得分等都无关的过程，将模型运行的研究重点放在资源分布上
6.本周收获
(1) 对资源分布模型中的想法进一步细化 (2) 对模型在理论上容易出现的问题进行了分析和学习
7.为课题组所做的服务性工作
无
2022-2023 学年第一学期 第 9 周
总 021 期 提交时间：2022年10月29日
1.本周目标
(1) 完成技术路线的修改和开题汇报PPT的制作 (2) 继续阅读文献和调试模型，及时完善注释及模型描述
2.本周实际做的工作
(1) 参考相关研究博士论文的技术路线，重新绘制了技术路线图 (2) 完成开题汇报ppt的制作，单页字数上还需要做最后的调整 (3) 比较了重新编程博弈匹配方式前后模型的运行结果，并尝试加入新的假设，令每个个体在一个时间步内能获取一单位的资源，从而使对每一步内未匹配到博弈对象（即没有进行博弈）的个体与进行过博弈个体在得分上有所区别，但有相同的依据
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
编程方面还需要调试，保证模型正常运行
5.下周目标
(1) 准备和进行开题报告的试讲，并根据意见进行调整与修改 (2) 根据上周考虑加入到模型中的新假设，进行编程和调试，比较运行结果是否合理，并及时完善注释和修改记录 (3) 继续阅读文献，了解和借鉴相关模型细节内容；安排一部分时间继续学习和复习演化博弈的理论知识，增加相关概念的理解
6.本周收获
(1) 对技术路线图需要表现的内容有了新的认识 (2) 在制作ppt中的研究方法部分的过程中，对基于智能体的模型和基于方程的数学模型进行了比较和总结，对ABM在研究上的优点有了进一步的认识
7.为课题组所做的服务性工作
无
2022-2023 学年第一学期 第 8 周
总 020 期 提交时间：2022年10月22日
1.本周目标
(1) 对研究框架进行完善，及时对文献综述做进一步的梳理和补充，并逐步开始制作开题汇报 PPT (2) 根据相关研究 ABM 模型学习到的经验，继续调试"基本模型"，并完善注释及模型描述
2.本周实际做的工作
(1) 修改开题报告研究框架，梳理文献综述，总结研究现状中的不足，并在开题报告ppt中体现 (2) 将研究内容根据下列三个科学问题重新进行了整理：① 空间异质性的博弈情境是否对合作演化造成影响？② 个体移动（空间隔离、空间的连通性）在空间异质性对合作演化的影响中起到什么作用？③ 与无条件的合作（欺骗）策略相比，重复囚徒困境竞赛中的复杂策略（如 “以牙还牙"及其变体）在空间异质性的博弈情境下如何演化（是否具有演化稳定的特性）？ (3) 将模型中的博弈交互对象的匹配方式重新进行了编程，确保每个主体在一个时间步内只进行一次博弈，使博弈得分积累的可比性更合理
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
仅从参考文献的标题、摘要和内容框架等了解相关研究的现状，对交互在模型中如何体现没有给出足够充分的细节信息（如邻居的类型是Von.Neumann型还是Moore型，模仿对象的选择是根据本轮博弈得分还是累积得分等）。因此，对一部分相关的文献，仍需要花费较多时间进一步了解模型细节。
5.下周目标
(1) 完成技术路线的修改和开题汇报PPT的制作 (2) 继续阅读文献和调试模型，及时完善注释及模型描述
6.本周收获
(1) 发现在相关研究模型细节上的认识存在的不足，理论学习仍需加强 (2) 解决了基本模型博弈对象匹配上的编程问题
7.为课题组所做的服务性工作
无
2022-2023 学年第一学期 第 7 周
总 019 期 提交时间：2022年10月15日
1.本周目标
(1) 拟写开题报告基本框架的文档 (2) 尝试将"基本模型"中的博弈过程改写为雪堆博弈 (3) 继续阅读文献，学习相关研究的 ABM 模型及演化博弈的相关理论
2.本周实际做的工作
(1) 拟写开题报告研究框架的文档 (2) 发现并修改了原"基本模型"编程上的问题 (3) 学习关于资源压力下合作演化的 ABM 模型
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
研究框架的章节设置仍需完善，以及针对科学问题对技术路线的细节进行调整
5.下周目标
(1) 对研究框架进行完善，及时对文献综述做进一步的梳理和补充，并逐步开始制作开题汇报 PPT (2) 根据相关研究 ABM 模型学习到的经验，继续调试"基本模型”，并完善注释及模型描述
6.本周收获
(1) 认识到目前研究框架的不足 (2) 从相关的ABM模型中，学习到非两个体经典博弈的相互作用在合作演化研究的应用
7.为课题组所做的服务性工作
无
2022-2023 学年第一学期 第 6 周
总 018 期 提交时间：2022年10月7日
1.本周目标
(1) 将较为经典的必读文献和与研究方向相关性较强的文献进行标记，并安排精读的计划，有序开展阅读学习 (2) 进一步学习了解"合作竞争基本模型"中的备选代码，并尝试对基本模型进行文字描述，可作为开题报告内容的一部分
2.本周实际做的工作
(1) 学习"基本模型"，完成部分简单的文字描述 (2) 阅读了 Hauert 关于空间结构抑制雪堆博弈中合作的论文 (3) 查看和学习了相关研究（已发表且经同行审议）的 ABM 模型 (4) 学习了和浏览了环境反馈（environment feedback）下的合作演化（即 eco-evolutionary game dynamic）的内容
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
基本完成。国庆期间，所在片区疫情形势复杂，两次被赋黄码，配合流调
4.如何改进
(1) 对正在学习的已发表 ABM 模型尚未理解（数量不仅限于当前一个），需在后续工作计划中继续安排学习 (2) 另外，可对环境反馈下的合作演化的相关内容进行补充梳理
5.下周目标
(1) 拟写开题报告基本框架的文档 (2) 尝试将"基本模型"中的博弈过程改写为雪堆博弈 (3) 继续阅读文献，学习相关研究的 ABM 模型及演化博弈的相关理论
6.本周收获
(1) 对雪堆博弈和囚徒困境的区别有了更加深入的理解 (2) 进一步了解了环境反馈下的合作演化的理论和进展 (3) 形成了对研究问题的初步想法
7.为课题组所做的服务性工作
无
2022-2023 学年第一学期 第 5 周
总 017 期 提交时间：2022年10月1日
1.本周目标
(1) 继续文献的整理和总结工作，将空间互惠的最新进展和ABM有关的研究作为重点 (2) 总结研究进展，编写和制作文献综述PPT
2.本周实际做的工作
(1) 继续搜集和阅读文献 (2) 整理和总结了空间互惠，生态情境和环境反馈对合作演化影响的研究进展 (3) 根据论文从相关网络社区上搜集到合作演化有关的ABM模型
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
考虑到与研究方向的侧重点未必一致，对一些强化学习有关和国内学者的研究了解较少，但其研究结论或可作为发展假说的启示及后续模拟实验的辅证
5.下周目标
(1) 将较为经典的必读文献和与研究方向相关性较强的文献进行标记，并安排精读的计划，有序开展阅读学习 (2) 进一步学习了解"合作竞争基本模型"中的备选代码，并尝试对基本模型进行文字描述，可作为开题报告内容的一部分 (3) 继续演化博弈相关的理论学习
6.本周收获
(1) 对国内外合作演化的进展有基本了解 (2) 熟悉合作演化的空间互惠研究中的理论和工具，包括网络互惠到空间互惠的发展，结构化种群中的演化博弈等
7.为课题组所做的服务性工作
无
2022-2023 学年第一学期 第 4 周
总 016 期 提交时间：2022年09月24日
1.本周目标
(1) 收集和整理文献，并有序地进行阅读和总结 (2) 了解"竞争合作基本模型"的运行
2.本周实际做的工作
(1) 了解了"竞争合作基本模型" (2) 从硕博论文入手，收集了合作演化研究中的文献若干 (3) 整理和快速浏览了关于合作演化研究的一些重要经典文献 (4) 对合作的五个机制及合作演化模型发展进行了总结
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
目前对相关研究内容已有进一步了解，在此基础上能够更加注意文献收集时的选择
5.下周目标
(1) 继续文献的整理和总结工作，将空间互惠的最新进展和ABM模型有关的研究作为重点 (2) 总结研究进展，编写和制作文献综述PPT (3) 继续演化博弈相关的理论学习
6.本周收获
(1) 更加了解相同方向研究生学位论文的选题 (2) 熟悉合作演化研究中一些常见的术语和博弈模型
7.为课题组所做的服务性工作
无
2022-2023 学年第一学期 第 3 周
总 015 期 提交时间：2022年09月17日
1.本周目标
(1) 了解NetLogo模型库中是否有与研究主题相关的模型可学习借鉴 (2) 根据基于个体模型收集文献
2.本周实际做的工作
(1) 阅读论文Tekwa2019，借助模型matlab代码及作者先前的论文理解模型理论 (2) 阅读石磊教授指导的硕士论文《合作的进化与惩罚的消失》 (3) 收集和整理ABM在合作演化研究中的文献若干
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
基本完成
4.如何改进
以开题为目标，调整下一步的工作重点。暂时减少理论的深入理解和对模型运行的关注，侧重于了解当前问题研究进展。
5.下周目标
(1) 继续收集和整理文献，并有序地进行阅读和总结（主要目标） (2) 了解"竞争合作基本模型"的运行 (3) 演化博弈的理论学习，考虑将从Tekwa模型理论获得的启发在NetLogo中实现的可能性（不限于下周）
6.本周收获
(1) 熟悉合作演化研究需要掌握的基本概念，了解接下来需要学习补充的理论知识 (2) 对相似研究的硕士论文框架有基本了解 (3) 在未掌握matlab使用的情况，也能根据其他编程语言的基础，对代码进行理解
7.为课题组所做的服务性工作
无
2022-2023 学年第一学期 第 2 周
总 014 期 提交时间：2022年09月10日
1.本周目标
(1) 阅读《合作的进化》 (2) 阅读论文Tekwa2019 (3) 了解进化稳定策略的相关概念
2.本周实际做的工作
(1) 读完《合作的进化》，对研究主题的整体有初步的认识；了解到与Aexlord计算机竞赛相关的Python库 (2) 阅读论文Tekwa2019，尚未理解模型理论 (3) 从进化稳定策略出发，以更加明确的方向继续了解研究主题
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
基本完成
4.如何改进
论文Tekwa2019提供了模型的matlab代码。学习和了解matlab的基本使用，有利于了解模型的运行规则，进一步理解其强调的理论。对后续工作中遇到同样使用matlab编写代码的论文也有帮助，但需要耗费一定时间。目前工作重点以了解进展和确定研究问题框架为主。
5.下周目标
(1) 收集文献，根据后续可确定的研究问题或者研究方法为基于个体模型等缩小搜索范围；有序安排文献阅读计划，以整理研究进展 (2) 了解NetLogo模型库中是否有与研究主题相关的模型可学习借鉴 (3) 为后续工作中论文的阅读和理解（不限于下周）：
- 学习进化稳定策略相关的博弈论概念
- 了解其他研究合作问题常用的博弈模型
- 学习和了解matlab的基本使用
6.本周收获
对研究主题形成初步认识
7.为课题组所做的服务性工作
无
2021-2022 学年第二学期 第 14 周
总 013 期 提交时间：2022年06月04日
1.本周目标
(1) 在目前对数据和该研究的理解情况的基础上，结合上述参考文献中需要注意的问题，尝试利用已有的变量绘制正确合理的因果图 (2) 根据情况看看数据中是否缺少模型需要的变量，如何获得（例如，通过实验的原始数据——物种丰度和性状测量等数据计算）？
2.本周实际做的工作
(1) 重新理清了论文 Schoolmaster2020 中的生物多样性-生态系统功能效应因果图模型框架 (2) 整理数据，计算了1公顷样地数据的多样性指数等，目前未发现各指数与生产力的相关性
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
基本完成
4.如何改进
Schoolmaster在文中提到生产力是生物多样性-生态系统功能效应的特殊情况，需要考虑慢的时间尺度来处理因果关系，以反映物种资源竞争导致性状差异对环境的反馈等。 因此，若研究问题和数据都不合适，工作将会事倍功半。
5.下周目标
(1) 若该数据的尝试未能成功，及时调整研究内容及思路——从生态学问题出发，尝试用因果科学的方法解决，或者在一个相关研究中引入因果推断的方法和思想 (2) 继续寻找生态学问题及开放、易获得的数据
6.本周收获
对生物多样性-生态系统功能效应的研究有进一步的了解。
7.为课题组所做的服务性工作
无
2021-2022 学年第二学期 第 13 周
总 012 期 提交时间：2022年05月28日
1.本周目标
(1) 根据论文对手头数据进行理解和整理 (2) 继续学习生态学或相关问题背景知识
2.本周实际做的工作
(1) 结合论文内容，以及文中的结构方程概念图，了解了数据中一些变量在研究中的作用，但仍一部分变量未理解
(2) 学习了R包FD中计算出的功能性状多样性指数所表示的含义
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
基本完成
4.如何改进
或许可以参考论文《A graphical causal model for resolving species identity effects and biodiversity-ecosystem function correlations》（Schoolmaster2020）以本文的评论（Grace2021)和回应（Schoolmaster2021）绘制更为合理的因果图
5.下周目标
(1) 在目前对数据和该研究的理解情况的基础上，结合上述参考文献中需要注意的问题，尝试利用已有的变量绘制正确合理的因果图 (2) 根据情况看看数据中是否缺少模型需要的变量，如何获得（例如，通过实验的原始数据——物种丰度和性状测量等数据计算）？
6.本周收获
(1) 学习了物种多样性指数，丰富度、均匀度、香浓多样性和谱系多样性等表示的含义 (2) 如何计算功能性状多样性指数，以及功能性状分散度、种群加权平均性状指数的含义 (3) 了解了比叶面积等性状与生产力可能存在的关系
7.为课题组所做的服务性工作
无
2021-2022 学年第二学期 第 12 周
总 011 期 提交时间：2022年05月21日
1.本周目标
(1) 整理因果推断解决内生性问题的方法和基于因果分析的解释性建模方法 (2) 学习生态学框架，检索和浏览更多文献及摘要
2.本周实际做的工作
(1) 根据因果分析的解释性建模方法，结合植物生物量和土壤有机碳储量的例子进行了因果图模型的建立和解释 (2) 整理了因果推断两个基本框架的主要内容 (3) 学习了一些感兴趣的生态学概念
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
基本完成
4.如何改进
在寻找科学问题时更多地考虑研究开展的可行性，对一些生态学概念还不够熟悉
5.下周目标
(1) 根据论文对手头数据进行理解和整理 (2) 继续学习生态学或相关问题背景知识
6.本周收获
了解因果分析的解释性建模方法在生态学中使用可能性，建模过程中的难点，以及和经典的结构方程模型之间区别等。
7.为课题组所做的服务性工作
无
2021-2022 学年第二学期 第 11 周
总 010 期 提交时间：2022年05月14日
1.本周目标
(1) 继续学习因果推断，断点回归的基础 (2) 整理目前已了解的因果推断方法中有哪些方便通过R包实现
2.本周实际做的工作
(1) 学习了断点回归基础知识
(2) 学习和比较了R包dagR和dagitty处理因果图的方法
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
基本完成
4.如何改进
调整学习内容的时间分配，思考可应用因果分析的研究问题
5.下周目标
(1) 整理因果推断解决内生性问题的方法和基于因果分析的解释性建模方法 (2) 学习生态学框架，检索和浏览更多文献及摘要
6.本周收获
(1) 了解了断点回归的原理和使用场景
(2) 学会如何使用R包dagR和dagitty构建和分析因果图
7.为课题组所做的服务性工作
无
2021-2022 学年第二学期 第 10 周
总 009 期 提交时间：2022年05月07日
1.本周目标
(1) 从R包did文档中提到的文献展开，学习双重差分法估计方法的新进展，在R语言中进行模拟和分析
(2) 收集因果推断相关的R包，整理文档中值得阅读的文献
2.本周实际做的工作
(1) 学习了R包did的基本使用方法，试运行了文档中的代码，对双向固定效应估计可能出现的问题进行模拟
(2) 阅读了文献《从双重差分法到事件研究法》，但未能较好地领会
(3) 收集因果推断相关的R包若干（caualOT、EValue、chest、causaldecomp）
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
基本完成
4.如何改进
(1) 在学习和使用新的估计方法时需要对其计量设定和基本假设有充分的认识 (2) 丰富生态学背景知识，为选题打开思路
5.下周目标
(1) 继续学习因果推断，断点回归的基础 (2) 整理目前已了解的因果推断方法中有哪些方便通过R包实现
6.本周收获
学习了R包did的基本使用方法，了解到did包作者Callaway等所提倡的交错双重差分法动态效应检验
7.为课题组所做的服务性工作
无
2021-2022 学年第二学期 第 9 周
总 008 期 提交时间：2022年04月30日
1.本周目标
(1) 准备好参加系统仿真建模大赛的材料 (2) 学习因果推断合成控制，阅读相关文献
2.本周实际做的工作
(1) 修改模型描述及ppt，注册比赛报名账号和了解模型提交的方式 (2) 学习了合成控制的基本原理，了解到双重差分法中标准估计方法可能存在的一些问题
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
基本完成
4.如何改进
(1) 补课开始后每周课程增多，需合理安排时间 (2) 及时巩固复习以提高学习相关新知识时的效率
5.下周目标
(1) 从R包"did"文档中提到的文献展开，继续学习双重差分法的进展，如何改进标准估计方法中的不足，在R语言中进行模拟和分析 (2) 收集因果推断相关的R包，整理文档中值得阅读的文献
6.本周收获
(1) 对双重差分法中的常见假定、参数估计方法有进一步的认识 (2) 了解到标准估计方法在多时段和异质性平均处理效应估计中存在的不足
7.为课题组所做的服务性工作
无
2021-2022 学年第二学期 第 8 周
总 007 期 提交时间：2022年04月23日
1.本周目标
(1) 完成系统仿真建模大赛模型描述的攥写 (2) 学习因果推断双重差分法DID
2.本周实际做的工作
(1) 完成了模型描述的攥写，开始制作ppt (2) 观看数学院关于因果推断与政策评价的报告，阅读了DID章节的内容
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
完成
4.如何改进
本周有两门课程需要进行课堂汇报，占用较多时间
5.下周目标
(1) 准备好所有系统仿真建模大赛要求提交的材料 (2) 学习因果推断合成控制，阅读相关文献
6.本周收获
(1) 学习到关于系统动力模型的一些应用场景 (2) 认识到因果推断与政策评价中大数据应用的特点，了解到异质性效应、协变量降维和溢出效应等研究趋势
7.为课题组所做的服务性工作
无
2021-2022 学年第二学期 第 7 周
总 006 期 提交时间：2022年04月16日
1.本周目标
(1) 继续开展混合模型的建模工作 (2) 巩固和整理因果推断目前的掌握情况
2.本周实际做的工作
(1) 分析和尝试解释了两个软件的系统动力模型模拟结果存在差异的可能原因，分工搜集和阅读了一些关于混合模型，以及森林与碳循环、碳中和的资料 (2) 整理了已掌握的因果推断统计方法，检索了一些方法在生态学的应用
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
未完成。分工完成情况待交流，对目前的系统动力模型细节以及背景知识的了解不足，限制了设计多智能体模型的思路
4.如何改进
针对性地补充一些与模型主题相关的背景知识
5.下周目标
(1) 明确多智能体模型中必要的状态变量细节，尝试确定可行的相互作用规则 (2) 学习因果推断双重差分法DID，合成控制
6.本周收获
学习了解森林生物量、碳储量和碳中和的相关概念，发现了关于多智能体模型思路上存在的问题
7.为课题组所做的服务性工作
无
2021-2022 学年第二学期 第 6 周
总 005 期 提交时间：2022年04月09日
1.本周目标
(1) 完成系统动力模型后，做一些多智能体模型结合的尝试 (2) 继续学习因果推断，将论文中提到的方法与已了解的方法更好地联系起来
2.本周实际做的工作
(1) 基本完成了将系统动力模型迁移到anylogic的工作，运行结果与vensim模型有一些不一致，具体细节仍在讨论和优化；阅读了将系统动力模型嵌入多智能体模型的文献以实例，为下一步工作列出了一些待解决的问题 (2) 阅读了Schoolmaster2020关于生物多样性-生态系统功能因果分析的论文，以及Grace2021对文章中观点提出的指正
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
基本完成，仍在推进
4.如何改进
(1) 未能直接下载到相似的Anylogic SD/ABM混合模型实例进行学习，但在文献(Martin2015)及其补充材料中看到Netlogo的混合模型的ODD框架，或对建模和模型介绍与写作有参考价值 (2) 不能保证目前对模型细节的认识完全正确
5.下周目标
(1) 继续开展混合模型的建模工作 (2) 巩固和整理因果推断目前的掌握情况
6.本周收获
(1) 获得一个可运行的系统动力模型，对系统动力模型和多智能体模型的特点，以及混合模型的技术思路有进一步的认识 (2) 了解到生物多样性-生态系统功能的因果图模型分析方法，以及可能出现的逻辑错误；同时加深了生态学中相关概念的理解
7.为课题组所做的服务性工作
无
2021-2022 学年第二学期 第 5 周
总 004 期 提交时间：2022年04月02日
1.本周目标
(1) 探索如何实现系统动力模型与多智能体模型的联系 (2) 根据论文和书籍学习因果推断，尝试对Grace文章中的方法原则进行总结，加深理解
2.本周实际做的工作
(1) 共同解决了在Anylogic中构建系统动力模型遇到的一些技术问题，考虑了结合多智能体模型的一些建模思路 (2) 学习了Grace文章中如何通过d-separation test和模型比较对因果结构模型进行修正的方法，以及在R中复现文章中的简单案例
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
基本完成
4.如何改进
可以适当分配时间用于收集并浏览多智能体模型的信息
5.下周目标
(1) 完成动力系统模型后，做一些多智能体模型结合的尝试 (2) 继续学习因果推断，将论文中提到的方法与已了解的方法更好地联系起来
6.本周收获
(1) 在一起解决在Anylogic中遇到的问题时，加深了对系统动力模型的理解 (2) 学习了与结构方程模型相关的因果分析方法，R包"piecewiseSEM"和"lavaan"的基本功能
7.为课题组所做的服务性工作
无
2021-2022 学年第二学期 第 4 周
总 003 期 提交时间：2022年03月26日
1.本周目标
(1) 阅读筛选到的文章摘要，继续增进对anylogic的了解 (2) 继续学习因果推断，粗读文献以了解其在特定领域的应用
2.本周实际做的工作
(1) 阅读文献分析筛选结果的摘要，收集资料，并讨论了模型主题 (2) 阅读了因果推断论文和书籍
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
基本完成
4.如何改进
加强理论复习与学习，为比赛和研究的后续工作做准备
5.下周目标
(1) 探索如何实现系统动力模型与多智能体模型的联系 (2) 根据论文和书籍学习因果推断，尝试对Grace文章中的方法原则进行总结，加深理解
6.本周收获
(1) 确定了系统仿真建模比赛模型的主题方向 (2) 了解因果推断术语的中文表述，认识一些尚未了解的相关统计方法 (3) 学习到在生态学上利用假设构建因果模型进行分析的思考方式
7.为课题组所做的服务性工作
无
2021-2022 学年第二学期 第 3 周
总 002 期 提交时间：2022年03月19日
1.本周目标
(1) Anylogic的文献分析和主题讨论 (2) 继续学习因果推断
2.本周实际做的工作
(1) 明确了建模比赛中的分工，从文献分析结果筛选了约四五篇文章作为参考，主题包括"environment"、“air-flow"等 (2) 尝试查找了往届比赛的作品，以及其他仿真建模比赛的作品，未能找到较多信息 (3) 找到并分享了比更好的anylogic软件学习资源 (4) 阅读了因果推断的书籍与论文
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
基本完成
4.如何改进
增加线上交流频率，适应在寝室工作遇到的问题，尝试从anylogic与netlogo建模的相似之处发现一些有参考价值的信息
5.下周目标
(1) 阅读筛选到的文章摘要以寻找灵感，继续增进对anylogic的了解 (2) 继续学习因果推断，粗读文献以了解其在特定领域的应用
6.本周收获
(1) 对软件中系统动力学建模的实现有初步了解 (2) 对潜在结果框架有更深入的认识，学习了工具变量IV基本知识
7.为课题组所做的服务性工作
无
2021-2022 学年第二学期 第 2 周
总 001 期 提交时间：2022年03月12日
1.本周目标
(1) 学习anylogic的基本操作，了解软件的特点，查找anylogic仿真相关的文献 (2) 继续学习因果推断
2.本周实际做的工作
(1) 学习了anylogic的操作，快速浏览了知网中一部分anylogic相关的论文主题 (2) 阅读了因果推断的书籍与论文 (3) 查找并阅读了Agent-based Modeling和自组织的论文
3.目标是否完成。如未完成需说明未完成原因
基本完成
4.如何改进
多交流anylogic的使用，进一步明确可能进行建模的主题或方向
5.下周目标
(1) 继续了解anylogic软件，搜集比赛及往届作品的信息 (2) 继续学习因果推断
6.本周收获
(1) 了解anylogic的基本使用，包括行人库和控制元件等基本元素，对软件能够完成哪些类型的仿真有初步认识 (2) 了解因果推断中由不同假设所获得的平均处理效应区间估计
7.为课题组所做的服务性工作
无